Initialement, je voulais calculer l'âge d'une mutation, en utilisant les haplotypes comme un principe d'horloge génétique.

Dans un contexte hospitalier, l'âge d'un variant ainsi calculé a un intérêt très restreint. La fréquence seule d'uns variantion est un excellent paramètre mais  utilisée à ce jour jusqu'à épuisement des possibilités. Dépasser cette seule dimension demande de maîtriser la relation entre haplotypes et graphe ancestral.

Le problème n'est pas réductible à des questions mathématiques, parce que les recombinaisons ont un rôle majeur dans la conservation et l'adaptation des séquences d'un génome.

Les mécanismes biologiques qui le permettent sont essentiels, et en tenir compte aide à comprendre l'information non codante.

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Question 1: Comment reconstituer le passé à l'aide des haplotypes?

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Question 2: Pourquoi l'information non codante?

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